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Realizations 2004-2012

Janvier 2004

L'architecture informatique prévue pour acceuillir les données du noeud suisse GBiF.ch a été présentée à Berne

Septembre 2004

La solution proposée a été réalisée et présentée à Berne. Cette architecture s'articulait autour des logiciels standards fournis par GBIF International permettant l'intégration du format Darwin Core.

Les tâches suivantes ont ainsi été réalisées :

  • Achat et installation d'un serveur sous Linux
  • Installation d'une base Oracle 9i
  • Intégration de données de test issues du musée d'histoire naturelle de Neuchâtel
  • Installation des packages standards GBIF (Digir Provider, GBIF Portal Toolkit, GBIF Data repository Tools, DiGIR Portal)
  • Intégration de données test au format texte et Excel

Décembre 2004 - août 2005

  • Refonte de l'infrastructure logicielle pour permettre l'intégration du format ABCD (projet BioCASE).
  • Modélisation, structuration de la base de données du noeud Suisse pour acceuillir ce format
  • Installation des logiciels nécessaires
  • Le 31 août 2005, la solution informatique est présentée à la commission scientifique

Septembre 2005 - octobre 2005

  • Analyse des problématiques d'intégration de données multi-langues
  • Analyse des problématiques d'intégration de données utilisant des terminologies différentes pour désigner le même attribut (systématique, stratigraphie, etc)
  • Etablissement d'un modèle de données intégrant un thésaurus hiérarchique pour résoudre les problématiques d'intégration multi-langues et multi-terminologies
  • Elaboration et mise en oeuvre d'un concept de sauvegarde des données du noeud informatique Suisse GBIF.ch
  • Document décrivant les données à fournir au noeud informatique suisse de GBIF ainsi que les modalités de formatage et de transfert de ces données

Novembre 2005 - avril 2006

  • Déploiement du modèle de données intégrant le thésaurus hiérarchique
  • Dévellopement d'une application de gestion de la base de données du noeud Suisse GBIF.ch. Cette application permet de gérer les structures de données complexes induites par l'intégration du concept de thésaurus hiérarchique
  • Etat destravaux au 1 février 2006
  • Récapitulatif des travaux effectués entre 2004 et 2006

Mai 2006

Novembre 2006

  • Les premières données à caractère zoologique fournies par le "Naturhistorisches Museum Bern" ont été intégrées dans la base de données du noeaud informatique Suisse. Elles ont été publiés sur le portail international de GBIF.
  • Le 8 novembre 2006, la solution retenue pour l'intégration de ce type de données est présentée lors de la journée d'information GBIF-Suisse.

Janvier 2007 - mai 2007

  • Déploiement du prototype de portail Internet permettant la réalisation d'interrogation multi-langue de la base de données GBIF.ch
  • Etat des travaux au 1 février 2007
  • Le 30 mars 2007, présentation au comité scientifique de GBIF.ch, du prototype de ce portail Internet développé par IT solution GBIF-Switzerland
  • Le 4 mai 2007, publication sur le réseau Herpnet , en test, des données de la collection d'hérpétologie / amphibiens du Muséum d'histoire naturelle de la Ville de Genève
  • Le 11 mai 2007, présentation pour la journée des conservateur des Musées d'histoire naturelle de Suisse, du prototype de portail Internet et des principales réalisations mise en oeuvre par IT-solution GBIF-Switzerland

Juin 2007 - décembre 2007

  • Développement d'une extension du prototype de portail Internet pour permettre la visualisation hiérarchique du thésaurus multilangue et 'accès aux données via la hiérarchie.
  • Réalisation d'une analyse de détail en vue d'étendre les fonctionnalité de la base de données GBIF.ch pour permettre l'intégration aux données contenant des organismes associées (hôtes, parasytes, symbiose...).
  • Travaux réalisés entre 2004-2007 et perspectives 2008-2011

Janvier 2008 - décembre 2009

  • Dévelloppement d'une extension de la base de données GBIF.ch pour permettre la réalisation de la première étape d'intégration des données contenant des oreganismes associés.
  • Intégration dans la base de données GBIF.ch de plus de 400'000 données de type observations/specimens fournies par les institutions suivantes: "Naturhistorisches Museum basel", du "Centre Suisse de Cartographie de la Faune", du Muséum d'Histoire Naturelle de la Ville de genève".
  • Le 29 mai 2008, ces données sont publiées sur le portail International de GBIF
  • Présentation des travaux réalisés en 2008 et perspectives 2009-2010
  • Développement du portail GBIF Suisse pour la diffusion des données
  • Chargement des données de diverses institutions

Janvier 2010 - décembre 2010

  • Développement de la version 2 de la base de données
  • Chargement des données de diverses institutions
  • Développement du module de géocodage
  • Développement du module de gestion des organismes associés

Janvier 2011 - décembre 2011

  • Développement de la version 2.1 de la base de données
  • Développement de la version 1.1 du portail de données GBIF Suisse
  • Chargement des données de diverses institutions et publication d'environ 1'300'000 données:
    • Centre Suisse de catographie de la Faune
    • Naturhistorisches Museum Basel
    • Muséum d'histoire naturellle de la Ville de Genève
    • Musée zoologique de Lausanne
    • Global Mountain Biodiversity Assessment
    • Koordinationsstelle Biodiversitäts-Monitoring
    • Mountain Invasion Research Network
  • Publication de ces données sur le portail GBIF international http://data.gbif.org
  • Publication de ces données sur le portail GBIF Suisse http://data.gbif.ch

Janvier 2012

  • Noeud informatique GBIF.ch - Solution d'intégration et de publication des données : Présentation des travaux aux responsables des bases de données nationales. Neuchâtel, le 17 janvier 2012

Septembre 2012

  • Noeud informatique GBIF.ch 2004-2012 - Base de données de la biodiversité suisse, Portail et Toolbox : Présentation aux membres du comité scientifique GBIF Suisse. Neuchâtel, le 13 septembre 2012.

Décembre 2012

  • Consolidation de la base de données GBIF.ch version 2.2
  • Consolidation du portail d'interrogation GBIF.ch version 1.1
  • Consolidation de la Toolbox GBIF.ch version 1.1
  • Documentation de la base de données, du portail et de la toolbox

Fin des développements informatiques de GBIF.ch (2004-2012) 

 Avril  2013